輔助功能M代碼以地址M為首后跟兩位數字組成，共100種（M00~M99）。它是控制機床輔助動作的指令，如主軸正轉、反轉及停止，冷卻液的開、關，工作臺的夾緊與松開，換刀，計劃停止，程序結束等。
　　
　　由于輔助功能指令與插補運算無直接關系，所以可寫在程序段的后面。
　　
　　在加工程序中正確使用M代碼是非常重要的，否則數控機床不能進行加工。編程時必須了解清楚所使用數控系統的M代碼和應用特點，才能正確使用。
　　
　　下面介紹一些常用的M代碼。
　　
　　1．M00——程序停止。在M00所在程序段其它指令執行后，用于停止主軸轉動，關閉冷卻液，停止進給，進入程序暫停狀態，以便執行諸如手動變速、換刀、測量工件等操作，如果要繼續執行，須重按“啟動鍵”。
　　
　　2．M01——任選（計劃）停止。M01指令與M00相似，差別在于M01指令執行時，操作者要預先接通控制面板上“任選停止”按鈕，否則M01功能不起作用。該指令常用于一些關鍵尺寸的抽樣檢測以及交接班臨時停止等情況。
　　
　　圖1所示是M01指令應用的例子。車削該軸時，為了知道尺寸d2是否合格，需要對*個零件進行測量，即程序執行到8位置時，刀具需退出，讓工人測量d2尺寸，等d2尺寸合格后再進行下去。這時可應用M01指令，程序過程如下：
　　
　　1→2→3→4→5→6→7→8→9→10→2→M01
　　
　　當*個零件合格后，作為*個零件測量用的程序段8→9、9→10、10→2從第二個零件起程序中就不需要了。為此只需要在上述三個程序段前以及M01前均加上跳步字符“/”（ISO標準編碼）即可。面板上還有一個“跳步”開關。在車削*個零件時，“跳步”開關斷開，“任選停止”開關接通，“/”對程序不起作用，而M01起作用，故可實現測量d2的要求。當加工第二個零件時，兩開關位置與上述相反，程序執行過程如下：
　　
　　1→2→3→4→5→6→7→8→11→12→13→1→M30
　　
　　3．M02——程序結束。該指令編在zui后一個程序段中。當全部程序執行完后，用此指令使主軸、進給、冷卻液均停止，并使數控系統處于復位狀態。
　　
　　4．M03、M04、M05——主軸正轉、反轉和停止指令。
　　
　　5．M06——換刀指令常用于加工中心機床刀庫換刀前的準備動作。
　　
　　6．M07、M08、M09——分別為霧狀冷卻液、液狀冷卻液開及冷卻液停的指令。
　　
　　7．M30——程序結束它與M02功能雖相似，但M30可使程序返回到開始狀態。